Фото: iStock
Фото: iStock

Биологи нашли общего предка всех бактерий

Изучая геномы анаэробных бактерий, немецкие биологи составили представление о метаболизме и физиологии последнего общего предка бактерий

Пять лет назад команда немецких ученых определила набор из 355 генов и описала физиологию и среду обитания последнего универсального общего предка — LUCA, от которого произошло все живое на Земле. Этот предок жил 3,48-4,5 миллиарда лет назад и не оставил нам никаких ископаемых остатков.

Теперь исследователи описали еще одну древнюю клетку, которую назвали Last Bacterial Common Ancestor — LBCA. LBCA — последний общий предок бактерий. Авторы считают, что первая бактерия на Земле появилась около 3,5 миллиарда лет назад в той же среде, что и LUCA. Исследование ученые опубликовали в журнале Communications Biology.

Бактерии по-другому передают друг другу генетический материал, не как мы с вами — вертикально, от родителя к ребенку, а латерально или горизонтально — от организма к организму-непотомку, поэтому они умеют обмениваться генетической информацией между разными штаммами. Здесь кроется серьезная проблема для ученых — при помощи традиционных филогенетических методов невозможно установить корень в древе эволюции бактерий.

Чтобы раскрыть генетический код общего предка всех бактерий, особенности его биохимии и филогении, ученые изучили геномы 1089 анаэробов — бактерий, которые могут обходиться без кислорода. В этих геномах есть 2 465 582 белковые последовательности, которые потом сгруппировали в 114 326 семейств. У 146 из них была минимум одна последовательность, присутствующая во всех 25 проанализированных основных таксономических группах — так ученые формировали почти полную базовую метаболическую сеть, а затем с помощью статистики определили, какие из современных бактериальных групп наиболее похожи на LBCA.

Отказ от аэробов имел для нас смысл. Если бактерии возникли в то время, когда Земля была бескислородной, то и нет смысла исследовать их происхождение, учитывая виды, полные адаптаций, вызванных кислородом

Доктор Джоана Ксавье, Ведущий автор исследования

Анализ показал, что самая ранняя расходящаяся ветвь бактерий была похожа на современные клостридии, за которыми следовали дельтапротеобактерии, актинобактерии и некоторые представители рода Aquifex

Фернандо Триа, Ответственный в проекте за разработку методов обработки информации

Авторы считают, что LBCA, скорее всего, подобно клостридиям, имел форму стержня, хотя не исключен и вариант спор, который позволил бы ранним клеткам выжить в суровых условиях ранней Земли.